2025/12/31

学術変革(A)マルチファセット・プロテインズの事後評価「A+」とMFP的なモノ

 私が代表を務めた学術変革領域研究(A)「マルチファセット・プロテインズ:拡大し変容するタンパク質の世界」(以下、MFP)が昨年度で終了した。


今年度、事後評価が実施されて必要資料を準備して結果を待っていたが、先週文科省のウェブサイトにて評価結果が公開された(→令和7年度 学術変革領域研究(A)に係る中間・事後評価について)。

A+

という最高評価ををいただいた(A+からC)。「A+」はなかなかいただけないのでたいへん嬉しい(以前の「新生鎖の生物学」はAだった)。以下、評価結果pdfに載っていた所見から本領域のところを引用する。

(評価結果の所見)

本研究領域は、これまでのタンパク質像からは想定できなかった多面的なタンパク質機能を見出し、拡大し変貌するタンパク質世界の理解を深めることで、タンパク質科学における新しい常識の確立を目的としている。この目的を達成するため、マクロな細胞を用いた解析、電顕レベルの微細構造解析、バイオインフォマティクスを駆使した情報解析の網羅的かつ緻密な連携により研究を推進した結果、非典型的翻訳、非AUG 翻訳、RAN 翻訳など多様な翻訳機構を世界に先駆けて明らかにし、既存のタンパク質研究の枠を超える飛躍的な理解をもたらした。ダークプロテイン、ダークプロテオームが最近、国際的に注目されるようになったという事実は本研究領域の先見性を示しており、変革や転換といった言葉に相応しいものである。また、研究領域の運営においては領域代表者のリーダーシップのもと、分野横断的な共同研究体制が構築されており、その結果として多くの成果が国際的な認知度の高い論文として発表されている。一方で、研究領域内での共同研究の成果に偏りが見られた点には物足りなさがあるため、今後は共同研究論文の発表が望まれる。本研究領域によりマルチファセットなタンパク質の描像が目覚ましく発展したため、将来的にはそれらを統合するような概念の創出に進むことを期待したい。

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領域が始まってから卒業生たちが3月の追いコン時にMFP領域のロゴ(多くのファセット(面)をもつダイヤモンドを領域のシンボルとした)のダイヤモンドに見立てたモノを見つけたり、作ったりして記念にくれることが多い。今年3月のはまだ紹介していなかったので、この機会に掲載する。

2025年3月 折りたたみ式コーヒードリッパー。商品のパッケージにあるようにコーヒーフィルターを置くのが基本だが、折りたたみ方を変えれば、ダイヤモンド的になる。



ドリッパーをシャペロニンGroELに見立てて「変性」させたキューブパズルを載せてみた


2024年3月 クリスタルパズル(3Dジグソーパズル)のダイヤモンド→20240921ブログ、→202401006ブログ


右にあるのは領域会議で作ってくれたMFPの内輪


2023年3月 「ストームグラス(容器に密閉された樟脳の結晶形が天気によって複雑に変化)」。本来の置き方をひっくり返しすとダイアモンド型になる。→20240921ブログ



2021年3月「マルチファセットプロテインズ」的なランプのギフト」→20210424ブログ

手作りでカラフルに仕上げてくれた逸品


2022年3月は「シャペロニンもどきの容器と自発的に「フォールディング」するメガネ拭き」(→202312ブログ)なのでMFPとは無関係だった。

2025/12/12

「ジーン・マシン」(ラマクリシュナン著:みすず書房)の解説を執筆

また私が関わった書籍の紹介である。このたび、「ジーン・マシン:細胞のタンパク質工場「リボソーム」をめぐる競争」(ヴェンカトラマン・ラマクリシュナン著、みすず書房)の解説を執筆した。


あらゆるタンパク質はリボソームで合成される。DNAからタンパク質へとつながる生命のセントラルドグマにおける「翻訳」という過程である。タンパク質を産む母なる分子であるリボソームは生命においてもっとも重要な分子の一つであり、その分子機構解明の研究も長い。リボソームは細胞内でもっとも巨大な複合体の一つであり、タンパク質とRNAから成っている。その詳細な立体構造解明は1990年代後半から熾烈なレースが繰り広げられた。本書はそのレースに参加して栄誉を勝ち取った一人であるヴェンカトラマン(通称ヴェンキ)・ラマクリシュナンの自伝である。ラマクリシュナンはリボソームの結晶構造解明の貢献でノーベル化学賞を2009年に受賞している。

一言で言えば、たいへんおもしろい本である。リボソームに関わらない人(一般の方から生命科学者も含めて)が読んでも、ノーベル賞が懸かった研究分野におけるレースの裏側が垣間見える。 私はこれを読んで大学時代に呼んだジェームズ・ワトソンの「二重らせん」を思い起こした。ワトソンはフランシス・クリックとともにDNAの二重らせん構造を解明し、分子生物学に革命を起こしたワトソンである。当時応用化学を専攻していた私が生命科学に興味を持つきっかけとなった一冊である。

詳細は、私が書いた解説「リボソームという「巨象」を解明する人間ドラマ」の半分ほどがみすず書房のウェブサイトにて『ジーン・マシン』解説(抄)として読めるのでぜひご覧ください(私の知り合いやリボソーム研究者には、ウェブサイトに載ってないところに興味深い内容を書いたことを付記しておく)。