2012/07/09

eSOLデータベースにシャペロン効果の網羅解析も追加

以下のエントリーに書いたシャペロン効果の網羅解析には全データをワークシートにまとめたサプリメントデータがあるので全体を解析したい方はぜひダウンロードを。

さらに、以前の大腸菌タンパク質の凝集形成の網羅解析(Niwa et al, PNAS 2009,解説論文pdf)の際に作ってもらったデータベース(eSOL: Solubility database of all E.coli proteins)にシャペロンのデータも追加してもらった。

http://www.tanpaku.org/tp-esol/

インターフェースも大幅に改善されてさらに使いやすくなったのでこちらも活用してほしい。

以下、このデータベースに関する解説の転載

-------------------------
この実験で得られたデータセット(約800個×3種のシャペロンの効果)は、シャペロンの作用機構の詳細な解析や、タンパク質一般に広く通用する凝集になりやすいタンパク質の可溶化手法の確立に向けた研究に役立つことが期待されます。タンパク質の可溶化法の一般則が見いだされれば、抗体医薬などの創薬やタンパク質の工業的利用などの分野に非常に有用な知見となります。
本研究で得られたデータセットはパブリックデータベースとして一般に公開されており、大学、企業を問わずタンパク質を用いた基礎研究・応用研究に広く利用されることが期待されます。

データベースの名称:eSOLデータベース
http://tp-esol.genes.nig.ac.jp/

eSOLデータベースは国立遺伝学研究所の菅原秀明教授らによって作成、運営されています。
-------------------------

0 コメント: